Protein–RNA interactions for Protein: Q16649

NFIL3, Nuclear factor interleukin-3-regulated protein, humanhuman

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Length 462 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIL3Q16649 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
NFIL3Q16649 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
NFIL3Q16649 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NFIL3Q16649 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
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