Protein–RNA interactions for Protein: Q15459

SF3A1, Splicing factor 3A subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A1Q15459 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SF3A1Q15459 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
SF3A1Q15459 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SF3A1Q15459 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
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