Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 RARRES2P11-201ENST00000635158 484 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
SHPRHQ149N8 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.67■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC32.66■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.65■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC32.65■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC32.64■■■□□ 2.82
SHPRHQ149N8 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.63■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC32.62■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.61■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC32.6■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHPRHQ149N8 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHPRHQ149N8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
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