Protein–RNA interactions for Protein: Q14498

RBM39, RNA-binding protein 39, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 530 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39Q14498 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
RBM39Q14498 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
RBM39Q14498 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
RBM39Q14498 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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