Protein–RNA interactions for Protein: Q14004

CDK13, Cyclin-dependent kinase 13, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK13Q14004 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.71■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.71■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
CDK13Q14004 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC36.69■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.67■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.66■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.66■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
CDK13Q14004 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.63■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.62■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.59■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.58■■■■□ 3.45
CDK13Q14004 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.55■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
CDK13Q14004 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
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