Protein–RNA interactions for Protein: Q13901

C1D, Nuclear nucleic acid-binding protein C1D, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1DQ13901 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
C1DQ13901 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1DQ13901 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1DQ13901 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1DQ13901 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1DQ13901 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1DQ13901 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1DQ13901 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1DQ13901 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1DQ13901 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1DQ13901 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
C1DQ13901 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1DQ13901 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1DQ13901 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1DQ13901 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
C1DQ13901 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1DQ13901 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1DQ13901 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1DQ13901 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1DQ13901 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
C1DQ13901 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
C1DQ13901 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1DQ13901 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1DQ13901 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1DQ13901 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1DQ13901 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1DQ13901 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
C1DQ13901 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1DQ13901 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1DQ13901 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1DQ13901 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1DQ13901 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1DQ13901 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1DQ13901 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1DQ13901 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
C1DQ13901 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
C1DQ13901 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
C1DQ13901 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1DQ13901 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1DQ13901 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1DQ13901 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1DQ13901 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1DQ13901 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1DQ13901 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1DQ13901 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1DQ13901 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1DQ13901 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1DQ13901 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1DQ13901 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
C1DQ13901 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C1DQ13901 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1DQ13901 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1DQ13901 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
C1DQ13901 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
C1DQ13901 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
C1DQ13901 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1DQ13901 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1DQ13901 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
C1DQ13901 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1DQ13901 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
C1DQ13901 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1DQ13901 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1DQ13901 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
C1DQ13901 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1DQ13901 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
C1DQ13901 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
C1DQ13901 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.9 ms