Protein–RNA interactions for Protein: Q13615

MTMR3, Myotubularin-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,198 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTMR3Q13615 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
MTMR3Q13615 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
MTMR3Q13615 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
MTMR3Q13615 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
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