Protein–RNA interactions for Protein: Q13421

MSLN, Mesothelin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSLNQ13421 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
MSLNQ13421 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
MSLNQ13421 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MSLNQ13421 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
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