Protein–RNA interactions for Protein: Q13114

TRAF3, TNF receptor-associated factor 3, humanhuman

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Length 568 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF3Q13114 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TRAF3Q13114 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
TRAF3Q13114 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
TRAF3Q13114 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms