Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SFSWAPQ12872 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 PLEKHO1-202ENST00000369126 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 ZNF784-202ENST00000591479 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
SFSWAPQ12872 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
SFSWAPQ12872 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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