Protein–RNA interactions for Protein: Q12816

TRO, Trophinin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,431 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TROQ12816 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TROQ12816 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TROQ12816 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TROQ12816 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
TROQ12816 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
TROQ12816 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TROQ12816 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TROQ12816 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TROQ12816 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TROQ12816 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC36.37■■■■□ 3.41
TROQ12816 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TROQ12816 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
TROQ12816 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.36■■■■□ 3.41
TROQ12816 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TROQ12816 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TROQ12816 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
TROQ12816 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TROQ12816 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TROQ12816 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
TROQ12816 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
TROQ12816 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TROQ12816 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TROQ12816 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TROQ12816 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC36.34■■■■□ 3.41
TROQ12816 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.33■■■■□ 3.41
TROQ12816 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC36.33■■■■□ 3.41
TROQ12816 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TROQ12816 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
TROQ12816 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TROQ12816 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
TROQ12816 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TROQ12816 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
TROQ12816 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
TROQ12816 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC36.32■■■■□ 3.4
TROQ12816 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC36.32■■■■□ 3.4
TROQ12816 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TROQ12816 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TROQ12816 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TROQ12816 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
TROQ12816 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
TROQ12816 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TROQ12816 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TROQ12816 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TROQ12816 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC36.3■■■■□ 3.4
TROQ12816 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TROQ12816 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
TROQ12816 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
TROQ12816 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
TROQ12816 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TROQ12816 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
TROQ12816 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
TROQ12816 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC36.28■■■■□ 3.4
TROQ12816 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TROQ12816 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC36.27■■■■□ 3.4
TROQ12816 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TROQ12816 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TROQ12816 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
TROQ12816 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC36.26■■■■□ 3.4
TROQ12816 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TROQ12816 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
TROQ12816 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
TROQ12816 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC36.26■■■■□ 3.39
TROQ12816 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TROQ12816 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TROQ12816 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TROQ12816 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TROQ12816 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TROQ12816 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TROQ12816 PARD6B-202ENST00000396039 522 ntTSL 1 (best) BASIC36.25■■■■□ 3.39
TROQ12816 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC36.25■■■■□ 3.39
TROQ12816 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC36.25■■■■□ 3.39
TROQ12816 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TROQ12816 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TROQ12816 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TROQ12816 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TROQ12816 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
TROQ12816 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TROQ12816 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TROQ12816 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
TROQ12816 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TROQ12816 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
TROQ12816 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
TROQ12816 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC36.23■■■■□ 3.39
TROQ12816 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC36.22■■■■□ 3.39
TROQ12816 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TROQ12816 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TROQ12816 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
TROQ12816 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
TROQ12816 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TROQ12816 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TROQ12816 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC36.21■■■■□ 3.39
TROQ12816 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
TROQ12816 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TROQ12816 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TROQ12816 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TROQ12816 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TROQ12816 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
TROQ12816 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
TROQ12816 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
TROQ12816 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
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