Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
APOBRQ0VD83 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
APOBRQ0VD83 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
APOBRQ0VD83 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms