Protein–RNA interactions for Protein: Q08378

GOLGA3, Golgin subfamily A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,498 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GOLGA3Q08378 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC38.35■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 RALB-208ENST00000631312 311 ntTSL 5 BASIC38.35■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC38.34■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC38.34■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.34■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.34■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC38.33■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC38.33■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC38.33■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.32■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC38.32■■■■□ 3.73
GOLGA3Q08378 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC38.31■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC38.31■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC38.31■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC38.31■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC38.3■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.3■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.29■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.29■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC38.28■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC38.28■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC38.27■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC38.27■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC38.27■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC38.26■■■■□ 3.72
GOLGA3Q08378 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.26■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC38.25■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC38.25■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC38.25■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC38.24■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC38.24■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC38.24■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC38.23■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.23■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC38.23■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC38.22■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC38.22■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38.22■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC38.22■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38.21■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC38.21■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC38.21■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 MIR6089-201ENST00000616698 64 ntBASIC38.21■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC38.2■■■■□ 3.71
GOLGA3Q08378 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC38.19■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.19■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC38.19■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC38.18■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC38.18■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC38.17■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC38.17■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.16■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC38.16■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC38.15■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC38.15■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC38.15■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.14■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC38.14■■■■□ 3.7
GOLGA3Q08378 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC38.13■■■■□ 3.69
GOLGA3Q08378 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38.13■■■■□ 3.69
GOLGA3Q08378 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC38.13■■■■□ 3.69
GOLGA3Q08378 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC38.13■■■■□ 3.69
GOLGA3Q08378 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38.11■■■■□ 3.69
GOLGA3Q08378 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC38.1■■■■□ 3.69
GOLGA3Q08378 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC38.1■■■■□ 3.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms