Protein–RNA interactions for Protein: Q06547

GABPB1, GA-binding protein subunit beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPB1Q06547 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 ST3GAL5-222ENST00000638572 4431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GABPB1Q06547 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 SNX3-201ENST00000230085 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
GABPB1Q06547 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
GABPB1Q06547 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms