Protein–RNA interactions for Protein: Q06432

CACNG1, Voltage-dependent calcium channel gamma-1 subunit, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNG1Q06432 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CACNG1Q06432 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
CACNG1Q06432 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
CACNG1Q06432 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms