Protein–RNA interactions for Protein: Q02535

ID3, DNA-binding protein inhibitor ID-3, humanhuman

Predictions only

Length 119 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ID3Q02535 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ID3Q02535 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ID3Q02535 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ID3Q02535 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ID3Q02535 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ID3Q02535 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ID3Q02535 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ID3Q02535 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ID3Q02535 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ID3Q02535 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ID3Q02535 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ID3Q02535 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ID3Q02535 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ID3Q02535 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ID3Q02535 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ID3Q02535 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ID3Q02535 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ID3Q02535 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ID3Q02535 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ID3Q02535 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ID3Q02535 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ID3Q02535 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ID3Q02535 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ID3Q02535 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ID3Q02535 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ID3Q02535 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ID3Q02535 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ID3Q02535 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ID3Q02535 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ID3Q02535 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ID3Q02535 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ID3Q02535 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ID3Q02535 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ID3Q02535 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ID3Q02535 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ID3Q02535 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ID3Q02535 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ID3Q02535 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ID3Q02535 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ID3Q02535 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ID3Q02535 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ID3Q02535 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ID3Q02535 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ID3Q02535 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ID3Q02535 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ID3Q02535 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ID3Q02535 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ID3Q02535 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ID3Q02535 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ID3Q02535 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ID3Q02535 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ID3Q02535 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ID3Q02535 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ID3Q02535 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ID3Q02535 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ID3Q02535 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ID3Q02535 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ID3Q02535 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ID3Q02535 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ID3Q02535 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ID3Q02535 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms