Protein–RNA interactions for Protein: Q02252

ALDH6A1, Methylmalonate-semialdehyde dehydrogenase [acylating], mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALDH6A1Q02252 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
ALDH6A1Q02252 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 MDK-203ENST00000395566 828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
ALDH6A1Q02252 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.1 ms