Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
TNFRSF17Q02223 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
TNFRSF17Q02223 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TNFRSF17Q02223 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms