Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
SCN7AQ01118 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 RPRD1A-207ENST00000588737 1264 ntTSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC29.52■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.32
SCN7AQ01118 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC29.5■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC29.49■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
SCN7AQ01118 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms