Protein–RNA interactions for Protein: P78413

IRX4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX4P78413 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX4P78413 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX4P78413 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX4P78413 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX4P78413 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX4P78413 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX4P78413 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX4P78413 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
IRX4P78413 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX4P78413 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX4P78413 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX4P78413 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX4P78413 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
IRX4P78413 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX4P78413 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX4P78413 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX4P78413 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX4P78413 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX4P78413 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX4P78413 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX4P78413 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX4P78413 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
IRX4P78413 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX4P78413 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX4P78413 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX4P78413 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX4P78413 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX4P78413 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX4P78413 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX4P78413 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
IRX4P78413 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX4P78413 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX4P78413 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX4P78413 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX4P78413 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX4P78413 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX4P78413 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX4P78413 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
IRX4P78413 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX4P78413 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX4P78413 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX4P78413 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
IRX4P78413 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX4P78413 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX4P78413 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX4P78413 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX4P78413 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX4P78413 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX4P78413 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
IRX4P78413 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
IRX4P78413 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX4P78413 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX4P78413 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX4P78413 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX4P78413 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX4P78413 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX4P78413 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX4P78413 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
IRX4P78413 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX4P78413 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX4P78413 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX4P78413 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX4P78413 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX4P78413 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX4P78413 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX4P78413 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX4P78413 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
IRX4P78413 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX4P78413 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX4P78413 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX4P78413 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
IRX4P78413 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX4P78413 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX4P78413 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX4P78413 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX4P78413 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX4P78413 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX4P78413 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
IRX4P78413 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
IRX4P78413 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX4P78413 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX4P78413 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX4P78413 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX4P78413 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX4P78413 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX4P78413 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX4P78413 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX4P78413 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
IRX4P78413 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX4P78413 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX4P78413 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX4P78413 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX4P78413 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX4P78413 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
IRX4P78413 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
IRX4P78413 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.8 ms