Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
HERVK_113P63132 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
HERVK_113P63132 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
HERVK_113P63132 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.9 ms