Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
HERVK_113P61574 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
HERVK_113P61574 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
HERVK_113P61574 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms