Protein–RNA interactions for Protein: P57768

SNX16, Sorting nexin-16, humanhuman

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX16P57768 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX16P57768 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX16P57768 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX16P57768 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX16P57768 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
SNX16P57768 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX16P57768 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX16P57768 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX16P57768 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX16P57768 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX16P57768 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX16P57768 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX16P57768 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SNX16P57768 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
SNX16P57768 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX16P57768 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX16P57768 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX16P57768 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX16P57768 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX16P57768 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX16P57768 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SNX16P57768 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX16P57768 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX16P57768 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX16P57768 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX16P57768 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX16P57768 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX16P57768 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SNX16P57768 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX16P57768 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX16P57768 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX16P57768 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX16P57768 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SNX16P57768 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX16P57768 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX16P57768 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX16P57768 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX16P57768 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX16P57768 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX16P57768 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SNX16P57768 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX16P57768 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX16P57768 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX16P57768 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX16P57768 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX16P57768 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX16P57768 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SNX16P57768 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX16P57768 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX16P57768 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX16P57768 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX16P57768 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX16P57768 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX16P57768 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX16P57768 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
SNX16P57768 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX16P57768 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX16P57768 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX16P57768 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX16P57768 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SNX16P57768 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX16P57768 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX16P57768 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX16P57768 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX16P57768 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX16P57768 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX16P57768 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX16P57768 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SNX16P57768 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX16P57768 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX16P57768 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SNX16P57768 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX16P57768 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX16P57768 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX16P57768 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX16P57768 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX16P57768 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNX16P57768 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX16P57768 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX16P57768 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX16P57768 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX16P57768 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX16P57768 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX16P57768 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX16P57768 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX16P57768 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX16P57768 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX16P57768 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNX16P57768 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX16P57768 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX16P57768 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX16P57768 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX16P57768 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX16P57768 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX16P57768 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNX16P57768 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX16P57768 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX16P57768 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX16P57768 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNX16P57768 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms