Protein–RNA interactions for Protein: P57087

JAM2, Junctional adhesion molecule B, humanhuman

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JAM2P57087 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
JAM2P57087 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
JAM2P57087 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
JAM2P57087 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
JAM2P57087 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
JAM2P57087 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
JAM2P57087 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
JAM2P57087 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
JAM2P57087 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
JAM2P57087 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
JAM2P57087 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
JAM2P57087 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
JAM2P57087 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
JAM2P57087 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
JAM2P57087 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
JAM2P57087 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
JAM2P57087 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
JAM2P57087 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
JAM2P57087 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
JAM2P57087 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
JAM2P57087 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
JAM2P57087 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
JAM2P57087 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
JAM2P57087 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
JAM2P57087 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
JAM2P57087 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JAM2P57087 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JAM2P57087 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
JAM2P57087 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JAM2P57087 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
JAM2P57087 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
JAM2P57087 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JAM2P57087 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JAM2P57087 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
JAM2P57087 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
JAM2P57087 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
JAM2P57087 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
JAM2P57087 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
JAM2P57087 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
JAM2P57087 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
JAM2P57087 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
JAM2P57087 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
JAM2P57087 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
JAM2P57087 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
JAM2P57087 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
JAM2P57087 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
JAM2P57087 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
JAM2P57087 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
JAM2P57087 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
JAM2P57087 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
JAM2P57087 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
JAM2P57087 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
JAM2P57087 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
JAM2P57087 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
JAM2P57087 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25■■□□□ 1.59
JAM2P57087 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
JAM2P57087 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
JAM2P57087 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
JAM2P57087 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
JAM2P57087 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
JAM2P57087 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
JAM2P57087 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
JAM2P57087 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
JAM2P57087 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
JAM2P57087 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
JAM2P57087 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
JAM2P57087 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JAM2P57087 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
JAM2P57087 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JAM2P57087 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JAM2P57087 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JAM2P57087 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
JAM2P57087 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
JAM2P57087 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
JAM2P57087 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
JAM2P57087 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
JAM2P57087 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
JAM2P57087 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JAM2P57087 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JAM2P57087 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JAM2P57087 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JAM2P57087 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
JAM2P57087 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JAM2P57087 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JAM2P57087 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JAM2P57087 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JAM2P57087 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
JAM2P57087 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JAM2P57087 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JAM2P57087 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
JAM2P57087 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JAM2P57087 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
JAM2P57087 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
JAM2P57087 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
JAM2P57087 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
JAM2P57087 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
JAM2P57087 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
JAM2P57087 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
JAM2P57087 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
JAM2P57087 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76 ms