Protein–RNA interactions for Protein: P54136

RARS, Arginine--tRNA ligase, cytoplasmic, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 660 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RARSP54136 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RARSP54136 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RARSP54136 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RARSP54136 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RARSP54136 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
RARSP54136 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
RARSP54136 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.06■■■□□ 2.4
RARSP54136 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RARSP54136 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RARSP54136 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RARSP54136 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RARSP54136 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RARSP54136 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
RARSP54136 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC30.06■■■□□ 2.4
RARSP54136 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RARSP54136 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RARSP54136 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RARSP54136 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RARSP54136 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RARSP54136 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
RARSP54136 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC30.05■■■□□ 2.4
RARSP54136 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RARSP54136 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RARSP54136 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC30.04■■■□□ 2.4
RARSP54136 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RARSP54136 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RARSP54136 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RARSP54136 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RARSP54136 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
RARSP54136 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RARSP54136 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC30.03■■■□□ 2.4
RARSP54136 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RARSP54136 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC30.03■■■□□ 2.4
RARSP54136 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RARSP54136 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
RARSP54136 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RARSP54136 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
RARSP54136 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RARSP54136 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC30.02■■■□□ 2.4
RARSP54136 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RARSP54136 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RARSP54136 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
RARSP54136 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RARSP54136 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RARSP54136 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RARSP54136 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.39
RARSP54136 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RARSP54136 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RARSP54136 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RARSP54136 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RARSP54136 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC30■■■□□ 2.39
RARSP54136 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC30■■■□□ 2.39
RARSP54136 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC30■■■□□ 2.39
RARSP54136 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
RARSP54136 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RARSP54136 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RARSP54136 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RARSP54136 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RARSP54136 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
RARSP54136 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
RARSP54136 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RARSP54136 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RARSP54136 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RARSP54136 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RARSP54136 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RARSP54136 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
RARSP54136 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.98■■■□□ 2.39
RARSP54136 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC29.97■■■□□ 2.39
RARSP54136 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RARSP54136 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
RARSP54136 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RARSP54136 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RARSP54136 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RARSP54136 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RARSP54136 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RARSP54136 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RARSP54136 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RARSP54136 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.96■■■□□ 2.39
RARSP54136 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
RARSP54136 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC29.95■■■□□ 2.39
RARSP54136 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RARSP54136 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.39
RARSP54136 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RARSP54136 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.95■■■□□ 2.38
RARSP54136 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RARSP54136 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RARSP54136 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RARSP54136 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RARSP54136 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RARSP54136 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RARSP54136 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
RARSP54136 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RARSP54136 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
RARSP54136 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RARSP54136 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
RARSP54136 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RARSP54136 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RARSP54136 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RARSP54136 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
RARSP54136 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.6 ms