Protein–RNA interactions for Protein: P53671

LIMK2, LIM domain kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK2P53671 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LIMK2P53671 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
LIMK2P53671 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
LIMK2P53671 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.6 ms