Protein–RNA interactions for Protein: P53667

LIMK1, LIM domain kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIMK1P53667 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
LIMK1P53667 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
LIMK1P53667 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 SMIM29-205ENST00000468145 903 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 SMIM29-207ENST00000481533 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
LIMK1P53667 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.6 ms