Protein–RNA interactions for Protein: P50607

TUB, Tubby protein homolog, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBP50607 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBP50607 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBP50607 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TUBP50607 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBP50607 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBP50607 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBP50607 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBP50607 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TUBP50607 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TUBP50607 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBP50607 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBP50607 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBP50607 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBP50607 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBP50607 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TUBP50607 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBP50607 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBP50607 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBP50607 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBP50607 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBP50607 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBP50607 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBP50607 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
TUBP50607 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TUBP50607 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBP50607 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBP50607 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBP50607 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBP50607 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBP50607 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBP50607 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBP50607 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBP50607 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TUBP50607 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBP50607 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBP50607 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBP50607 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBP50607 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBP50607 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBP50607 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBP50607 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBP50607 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBP50607 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
TUBP50607 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBP50607 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBP50607 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBP50607 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBP50607 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
TUBP50607 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBP50607 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBP50607 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBP50607 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TUBP50607 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBP50607 ZNF428-201ENST00000300811 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBP50607 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBP50607 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBP50607 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBP50607 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBP50607 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBP50607 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBP50607 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TUBP50607 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBP50607 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
TUBP50607 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBP50607 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBP50607 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBP50607 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TUBP50607 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBP50607 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBP50607 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBP50607 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBP50607 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBP50607 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBP50607 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBP50607 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBP50607 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TUBP50607 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TUBP50607 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms