Protein–RNA interactions for Protein: P50591

TNFSF10, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 10, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFSF10P50591 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TNFSF10P50591 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TNFSF10P50591 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF10P50591 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF10P50591 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF10P50591 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF10P50591 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF10P50591 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF10P50591 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF10P50591 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF10P50591 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF10P50591 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TNFSF10P50591 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF10P50591 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF10P50591 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF10P50591 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF10P50591 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TNFSF10P50591 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF10P50591 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF10P50591 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF10P50591 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF10P50591 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF10P50591 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF10P50591 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF10P50591 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF10P50591 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TNFSF10P50591 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TNFSF10P50591 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF10P50591 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF10P50591 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF10P50591 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF10P50591 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TNFSF10P50591 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF10P50591 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF10P50591 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF10P50591 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF10P50591 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF10P50591 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TNFSF10P50591 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TNFSF10P50591 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms