Protein–RNA interactions for Protein: P50238

CRIP1, Cysteine-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 77 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRIP1P50238 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CRIP1P50238 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CRIP1P50238 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.2 ms