Protein–RNA interactions for Protein: P49848

TAF6, Transcription initiation factor TFIID subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 677 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF6P49848 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF6P49848 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF6P49848 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF6P49848 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF6P49848 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF6P49848 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF6P49848 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TAF6P49848 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF6P49848 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF6P49848 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF6P49848 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF6P49848 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF6P49848 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF6P49848 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF6P49848 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF6P49848 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TAF6P49848 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF6P49848 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF6P49848 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF6P49848 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF6P49848 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF6P49848 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF6P49848 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TAF6P49848 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TAF6P49848 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF6P49848 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF6P49848 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
TAF6P49848 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF6P49848 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF6P49848 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TAF6P49848 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF6P49848 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF6P49848 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF6P49848 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF6P49848 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF6P49848 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF6P49848 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF6P49848 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF6P49848 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF6P49848 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF6P49848 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TAF6P49848 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TAF6P49848 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF6P49848 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF6P49848 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF6P49848 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF6P49848 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF6P49848 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF6P49848 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF6P49848 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TAF6P49848 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF6P49848 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF6P49848 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF6P49848 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF6P49848 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF6P49848 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF6P49848 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF6P49848 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF6P49848 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF6P49848 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TAF6P49848 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TAF6P49848 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF6P49848 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF6P49848 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF6P49848 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF6P49848 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF6P49848 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF6P49848 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TAF6P49848 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF6P49848 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF6P49848 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF6P49848 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF6P49848 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF6P49848 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF6P49848 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF6P49848 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TAF6P49848 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF6P49848 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF6P49848 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF6P49848 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF6P49848 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF6P49848 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF6P49848 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF6P49848 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF6P49848 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF6P49848 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TAF6P49848 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TAF6P49848 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms