Protein–RNA interactions for Protein: P49841

GSK3B, Glycogen synthase kinase-3 beta, humanhuman

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GSK3BP49841 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GSK3BP49841 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 TTC39A-203ENST00000371747 1876 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GSK3BP49841 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GSK3BP49841 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms