Protein–RNA interactions for Protein: P49674

CSNK1E, Casein kinase I isoform epsilon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSNK1EP49674 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
CSNK1EP49674 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 BTBD6-205ENST00000536364 1973 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CSNK1EP49674 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 C7orf25-205ENST00000438029 1743 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 AC019163.1-201ENST00000512634 610 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 SAC3D1-201ENST00000398846 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 AC135279.3-201ENST00000610945 1311 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CSNK1EP49674 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms