Protein–RNA interactions for Protein: P48443

RXRG, Retinoic acid receptor RXR-gamma, humanhuman

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RXRGP48443 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RXRGP48443 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
RXRGP48443 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
RXRGP48443 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RXRGP48443 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RXRGP48443 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RXRGP48443 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
RXRGP48443 LRRC1-201ENST00000370882 808 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RXRGP48443 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RXRGP48443 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
RXRGP48443 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RXRGP48443 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
RXRGP48443 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RXRGP48443 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RXRGP48443 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RXRGP48443 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RXRGP48443 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
RXRGP48443 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
RXRGP48443 SNRNP70-206ENST00000598441 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RXRGP48443 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
RXRGP48443 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RXRGP48443 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RXRGP48443 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RXRGP48443 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RXRGP48443 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RXRGP48443 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RXRGP48443 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
RXRGP48443 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
RXRGP48443 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
RXRGP48443 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RXRGP48443 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RXRGP48443 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RXRGP48443 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RXRGP48443 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RXRGP48443 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RXRGP48443 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
RXRGP48443 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
RXRGP48443 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RXRGP48443 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RXRGP48443 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RXRGP48443 EIF3J-203ENST00000535391 925 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
RXRGP48443 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RXRGP48443 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
RXRGP48443 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
RXRGP48443 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RXRGP48443 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RXRGP48443 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RXRGP48443 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RXRGP48443 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RXRGP48443 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
RXRGP48443 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
RXRGP48443 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RXRGP48443 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RXRGP48443 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RXRGP48443 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RXRGP48443 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
RXRGP48443 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
RXRGP48443 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RXRGP48443 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RXRGP48443 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RXRGP48443 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RXRGP48443 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
RXRGP48443 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
RXRGP48443 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RXRGP48443 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
RXRGP48443 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 PAOX-203ENST00000357296 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
RXRGP48443 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
RXRGP48443 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RXRGP48443 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
RXRGP48443 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RXRGP48443 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RXRGP48443 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RXRGP48443 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
RXRGP48443 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
RXRGP48443 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RXRGP48443 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RXRGP48443 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
RXRGP48443 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms