Protein–RNA interactions for Protein: P48431

SOX2, Transcription factor SOX-2, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX2P48431 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX2P48431 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX2P48431 PLEK2-201ENST00000216446 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX2P48431 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX2P48431 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX2P48431 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX2P48431 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX2P48431 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
SOX2P48431 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
SOX2P48431 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX2P48431 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX2P48431 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX2P48431 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX2P48431 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX2P48431 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX2P48431 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX2P48431 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX2P48431 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
SOX2P48431 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX2P48431 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX2P48431 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX2P48431 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
SOX2P48431 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX2P48431 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX2P48431 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX2P48431 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX2P48431 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX2P48431 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX2P48431 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
SOX2P48431 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SOX2P48431 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX2P48431 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX2P48431 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX2P48431 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX2P48431 LYL1-201ENST00000264824 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX2P48431 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX2P48431 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX2P48431 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX2P48431 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX2P48431 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SOX2P48431 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX2P48431 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX2P48431 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX2P48431 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX2P48431 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX2P48431 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SOX2P48431 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOX2P48431 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
SOX2P48431 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX2P48431 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX2P48431 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX2P48431 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SOX2P48431 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX2P48431 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX2P48431 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX2P48431 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX2P48431 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX2P48431 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX2P48431 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX2P48431 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX2P48431 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX2P48431 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX2P48431 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SOX2P48431 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX2P48431 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX2P48431 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX2P48431 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX2P48431 YWHAH-201ENST00000248975 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX2P48431 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX2P48431 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX2P48431 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX2P48431 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SOX2P48431 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SOX2P48431 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX2P48431 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX2P48431 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX2P48431 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SOX2P48431 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms