Protein–RNA interactions for Protein: P46093

GPR4, G-protein coupled receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPR4P46093 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR4P46093 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR4P46093 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR4P46093 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR4P46093 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR4P46093 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR4P46093 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR4P46093 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR4P46093 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR4P46093 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
GPR4P46093 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
GPR4P46093 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
GPR4P46093 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR4P46093 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR4P46093 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR4P46093 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR4P46093 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR4P46093 GPR160-201ENST00000355897 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
GPR4P46093 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR4P46093 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR4P46093 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR4P46093 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR4P46093 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR4P46093 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR4P46093 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
GPR4P46093 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
GPR4P46093 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR4P46093 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR4P46093 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR4P46093 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR4P46093 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR4P46093 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
GPR4P46093 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR4P46093 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR4P46093 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR4P46093 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR4P46093 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR4P46093 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR4P46093 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR4P46093 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR4P46093 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
GPR4P46093 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR4P46093 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR4P46093 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR4P46093 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR4P46093 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR4P46093 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR4P46093 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
GPR4P46093 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR4P46093 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR4P46093 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR4P46093 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR4P46093 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR4P46093 AK8-201ENST00000298545 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR4P46093 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR4P46093 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR4P46093 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR4P46093 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR4P46093 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
GPR4P46093 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
GPR4P46093 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR4P46093 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR4P46093 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
GPR4P46093 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms