Protein–RNA interactions for Protein: P43088

PTGFR, Prostaglandin F2-alpha receptor, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGFRP43088 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
PTGFRP43088 CCND3-223ENST00000616010 2047 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 FOXO3B-201ENST00000395675 1928 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PTGFRP43088 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
PTGFRP43088 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms