Protein–RNA interactions for Protein: P42785

PRCP, Lysosomal Pro-X carboxypeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRCPP42785 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRCPP42785 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
PRCPP42785 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRCPP42785 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRCPP42785 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRCPP42785 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PRCPP42785 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRCPP42785 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRCPP42785 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRCPP42785 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
PRCPP42785 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRCPP42785 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRCPP42785 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRCPP42785 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PRCPP42785 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRCPP42785 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRCPP42785 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRCPP42785 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRCPP42785 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRCPP42785 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRCPP42785 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRCPP42785 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PRCPP42785 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRCPP42785 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PRCPP42785 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRCPP42785 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRCPP42785 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRCPP42785 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PRCPP42785 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRCPP42785 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PRCPP42785 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRCPP42785 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRCPP42785 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRCPP42785 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PRCPP42785 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRCPP42785 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PRCPP42785 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRCPP42785 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRCPP42785 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRCPP42785 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRCPP42785 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRCPP42785 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PRCPP42785 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRCPP42785 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRCPP42785 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRCPP42785 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRCPP42785 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRCPP42785 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRCPP42785 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRCPP42785 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRCPP42785 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRCPP42785 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PRCPP42785 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PRCPP42785 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRCPP42785 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRCPP42785 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRCPP42785 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRCPP42785 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PRCPP42785 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRCPP42785 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRCPP42785 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRCPP42785 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRCPP42785 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRCPP42785 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRCPP42785 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRCPP42785 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PRCPP42785 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRCPP42785 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRCPP42785 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRCPP42785 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRCPP42785 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRCPP42785 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRCPP42785 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRCPP42785 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRCPP42785 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRCPP42785 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PRCPP42785 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRCPP42785 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRCPP42785 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PRCPP42785 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRCPP42785 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRCPP42785 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRCPP42785 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRCPP42785 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRCPP42785 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PRCPP42785 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PRCPP42785 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms