Protein–RNA interactions for Protein: P42356

PI4KA, Phosphatidylinositol 4-kinase alpha, humanhuman

Predictions only

Length 2,102 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PI4KAP42356 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 C16orf87-201ENST00000285697 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 CCDC107-203ENST00000378407 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 FAM222B-213ENST00000583522 556 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PI4KAP42356 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.02■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC23■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 FBXL6-202ENST00000455319 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PI4KAP42356 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PI4KAP42356 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PI4KAP42356 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PI4KAP42356 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PI4KAP42356 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PI4KAP42356 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.9 ms