Protein–RNA interactions for Protein: P42261

GRIA1, Glutamate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIA1P42261 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GRIA1P42261 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GRIA1P42261 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms