Protein–RNA interactions for Protein: P35609

ACTN2, Alpha-actinin-2, humanhuman

Predictions only

Length 894 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN2P35609 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.59■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ACTN2P35609 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
ACTN2P35609 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ACTN2P35609 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms