Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC1P35052 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC1P35052 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC1P35052 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC1P35052 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC1P35052 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC1P35052 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC1P35052 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC1P35052 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC1P35052 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC1P35052 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GPC1P35052 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC1P35052 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC1P35052 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC1P35052 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC1P35052 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC1P35052 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC1P35052 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC1P35052 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GPC1P35052 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
GPC1P35052 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC1P35052 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC1P35052 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC1P35052 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC1P35052 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GPC1P35052 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC1P35052 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC1P35052 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC1P35052 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GPC1P35052 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GPC1P35052 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC1P35052 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC1P35052 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC1P35052 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC1P35052 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC1P35052 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC1P35052 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC1P35052 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC1P35052 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GPC1P35052 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC1P35052 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC1P35052 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC1P35052 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC1P35052 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC1P35052 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC1P35052 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC1P35052 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC1P35052 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC1P35052 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GPC1P35052 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC1P35052 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC1P35052 CTF1-201ENST00000279804 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GPC1P35052 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC1P35052 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC1P35052 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC1P35052 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC1P35052 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC1P35052 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC1P35052 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC1P35052 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC1P35052 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC1P35052 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GPC1P35052 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC1P35052 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC1P35052 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC1P35052 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC1P35052 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC1P35052 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC1P35052 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
GPC1P35052 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC1P35052 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC1P35052 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC1P35052 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC1P35052 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC1P35052 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC1P35052 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC1P35052 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC1P35052 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC1P35052 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
GPC1P35052 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC1P35052 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC1P35052 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC1P35052 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC1P35052 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC1P35052 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
GPC1P35052 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms