Protein–RNA interactions for Protein: P31431

SDC4, Syndecan-4, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDC4P31431 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDC4P31431 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDC4P31431 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDC4P31431 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SDC4P31431 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SDC4P31431 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SDC4P31431 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDC4P31431 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDC4P31431 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDC4P31431 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDC4P31431 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDC4P31431 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDC4P31431 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SDC4P31431 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDC4P31431 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDC4P31431 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDC4P31431 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDC4P31431 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDC4P31431 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SDC4P31431 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
SDC4P31431 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDC4P31431 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SDC4P31431 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDC4P31431 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDC4P31431 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
SDC4P31431 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDC4P31431 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDC4P31431 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDC4P31431 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SDC4P31431 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDC4P31431 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDC4P31431 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDC4P31431 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDC4P31431 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SDC4P31431 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SDC4P31431 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDC4P31431 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDC4P31431 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDC4P31431 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDC4P31431 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SDC4P31431 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDC4P31431 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDC4P31431 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SDC4P31431 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDC4P31431 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
SDC4P31431 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SDC4P31431 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SDC4P31431 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDC4P31431 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDC4P31431 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDC4P31431 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDC4P31431 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDC4P31431 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDC4P31431 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDC4P31431 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SDC4P31431 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SDC4P31431 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDC4P31431 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDC4P31431 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SDC4P31431 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDC4P31431 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDC4P31431 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDC4P31431 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDC4P31431 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDC4P31431 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SDC4P31431 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDC4P31431 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDC4P31431 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SDC4P31431 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDC4P31431 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDC4P31431 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDC4P31431 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDC4P31431 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SDC4P31431 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SDC4P31431 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDC4P31431 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDC4P31431 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SDC4P31431 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.6 ms