Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 RAB20-201ENST00000267328 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 PDSS1-201ENST00000376215 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 BCKDHB-202ENST00000356489 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
MARCKSP29966 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 ARL4D-201ENST00000320033 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
MARCKSP29966 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 FHL2-203ENST00000358129 1578 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
MARCKSP29966 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms