Protein–RNA interactions for Protein: P29400

COL4A5, Collagen alpha-5(IV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL4A5P29400 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
COL4A5P29400 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 SRD5A1P1-201ENST00000442297 786 ntBASIC28.58■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 CCR10-201ENST00000332438 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 GATM-206ENST00000558336 1522 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
COL4A5P29400 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 AQP10-201ENST00000324978 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 YJEFN3-201ENST00000436027 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
COL4A5P29400 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 KBTBD13-201ENST00000432196 1377 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
COL4A5P29400 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms