Protein–RNA interactions for Protein: P26374

CHML, Rab proteins geranylgeranyltransferase component A 2, humanhuman

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHMLP26374 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMLP26374 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMLP26374 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CHMLP26374 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMLP26374 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMLP26374 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMLP26374 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMLP26374 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CHMLP26374 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CHMLP26374 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
CHMLP26374 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMLP26374 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMLP26374 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMLP26374 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMLP26374 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMLP26374 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMLP26374 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CHMLP26374 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHMLP26374 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHMLP26374 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHMLP26374 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
CHMLP26374 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMLP26374 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMLP26374 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMLP26374 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMLP26374 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CHMLP26374 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMLP26374 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMLP26374 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMLP26374 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMLP26374 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMLP26374 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMLP26374 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMLP26374 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMLP26374 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMLP26374 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
CHMLP26374 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMLP26374 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMLP26374 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMLP26374 SLC9A3-203ENST00000514375 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMLP26374 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMLP26374 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMLP26374 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CHMLP26374 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CHMLP26374 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHMLP26374 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHMLP26374 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
CHMLP26374 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMLP26374 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMLP26374 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMLP26374 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMLP26374 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMLP26374 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMLP26374 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMLP26374 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMLP26374 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMLP26374 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CHMLP26374 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMLP26374 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMLP26374 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMLP26374 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMLP26374 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMLP26374 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CHMLP26374 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMLP26374 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMLP26374 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMLP26374 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMLP26374 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMLP26374 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMLP26374 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMLP26374 AMZ2P1-201ENST00000397713 2259 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMLP26374 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CHMLP26374 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMLP26374 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMLP26374 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMLP26374 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CHMLP26374 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CHMLP26374 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms