Protein–RNA interactions for Protein: P21127

CDK11B, Cyclin-dependent kinase 11B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 795 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK11BP21127 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CDK11BP21127 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 SDS-201ENST00000257549 1606 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 PGR-AS1-202ENST00000632820 1545 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 ELOC-206ENST00000520242 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 HMCES-204ENST00000502878 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 CCNJL-201ENST00000257536 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
CDK11BP21127 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
CDK11BP21127 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms