Protein–RNA interactions for Protein: P20036

HLA-DPA1, HLA class II histocompatibility antigen, DP alpha 1 chain, humanhuman

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DPA1P20036 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HLA-DPA1P20036 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HLA-DPA1P20036 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
HLA-DPA1P20036 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms