Protein–RNA interactions for Protein: P19532

TFE3, Transcription factor E3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 575 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFE3P19532 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFE3P19532 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFE3P19532 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFE3P19532 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFE3P19532 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFE3P19532 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFE3P19532 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TFE3P19532 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFE3P19532 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFE3P19532 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFE3P19532 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFE3P19532 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFE3P19532 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFE3P19532 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFE3P19532 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TFE3P19532 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFE3P19532 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFE3P19532 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFE3P19532 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFE3P19532 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFE3P19532 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFE3P19532 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFE3P19532 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TFE3P19532 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TFE3P19532 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFE3P19532 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TFE3P19532 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFE3P19532 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
TFE3P19532 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFE3P19532 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFE3P19532 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFE3P19532 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
TFE3P19532 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFE3P19532 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFE3P19532 ST3GAL5-231ENST00000639119 2131 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFE3P19532 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFE3P19532 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFE3P19532 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFE3P19532 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFE3P19532 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TFE3P19532 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
TFE3P19532 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFE3P19532 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
TFE3P19532 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TFE3P19532 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFE3P19532 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
TFE3P19532 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFE3P19532 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFE3P19532 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TFE3P19532 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFE3P19532 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFE3P19532 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFE3P19532 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFE3P19532 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFE3P19532 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFE3P19532 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
TFE3P19532 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
TFE3P19532 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
TFE3P19532 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFE3P19532 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFE3P19532 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFE3P19532 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
TFE3P19532 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
TFE3P19532 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFE3P19532 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFE3P19532 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
TFE3P19532 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFE3P19532 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
TFE3P19532 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
TFE3P19532 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFE3P19532 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFE3P19532 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFE3P19532 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
TFE3P19532 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFE3P19532 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFE3P19532 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFE3P19532 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
TFE3P19532 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFE3P19532 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
TFE3P19532 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFE3P19532 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFE3P19532 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
TFE3P19532 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFE3P19532 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFE3P19532 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
TFE3P19532 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFE3P19532 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFE3P19532 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFE3P19532 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFE3P19532 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFE3P19532 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TFE3P19532 AC011551.1-201ENST00000614101 683 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
TFE3P19532 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TFE3P19532 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFE3P19532 LRRC14B-201ENST00000328278 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFE3P19532 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFE3P19532 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFE3P19532 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFE3P19532 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TFE3P19532 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms