Protein–RNA interactions for Protein: P16234

PDGFRA, Platelet-derived growth factor receptor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,089 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFRAP16234 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PDGFRAP16234 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 NR6A1-201ENST00000344523 1846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 PPP1CC-206ENST00000550991 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PDGFRAP16234 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 SLIT1-203ENST00000371041 1695 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 MROH6-202ENST00000524906 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
PDGFRAP16234 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PDGFRAP16234 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms